Diverses informations concordantes font état de la collusion avérée du Polisario avec le GSPC, mouvement salafiste algérien intégriste, qui s’est rallié à Al-Qaïda et qui prône la lutte armée contre les états mécréants de la région, à commencer par l’Algérie. L’incident meurtrier des dernières semaines, au cours duquel un convoi armé du Polisario a été la cible d’une attaque en règle menée par un hélicoptère militaire algérien, car le convoi qui se dirigeait vers des grottes dans le désert, était soupçonné de ravitailler le GSPC  en armes et provisions, en vue d’une opération en commun.
La collusion avec les groupes des narcotrafiquants  et les réseaux mafieux locaux  du sahel africain et des deux rives de la Méditerranée constitue une autre facette du mode de fonctionnement du Polisario. Les observateurs et les experts internationaux de la lutte contre la drogue ne cessent de tirer la sonnette d’alarme sur cette situation troublante et dangereuse et d’alerter, dans le même élan, décideurs politiques et sécuritaires sur le potentiel de cette menace qui n’a pas de nom pour l’ensemble des pays riverains du Sahara. Le danger est que cette vaste zone désertique, s’étendant de la mer atlantique jusqu’aux confins du Nil, ne devienne, à l’instar du golfe du Mexique ou des Caraïbes, une zone franche de transhumance des convois de drogue et d’armes, infestée de groupes armés et de contrebandiers de toutes sortes, mettant à mal les économies fragiles des pays de la région et menaçant la stabilité et la sécurité de la région du Maghreb et du Sahel africain.